Il y a plusieurs années, un démon renard à neuf queue terrorisait et détruisait tout. Mais un jour, les Hokages du village décidèrent de combattre ce démon. Ils réunirent une troupe de ninjas mais alors qu'il perdaient la bataille, un jeune homme qui n'était autre que le 4ème Hokage(Yondaime) réussit à sceller l'esprit du démon renard dans le corps d'un enfant dont on venait de couper le cordon ombilical, mais mourru.
Plusieurs années on passé dans le village de Konoha le jeune garçon en qui fut scellé le démon a désormais 12 ans et il s'appelle Naruto. Naruto est orphelin et personne ne s'occupe de lui donc pour se faire remarquer il fait sans cesse des bétises dont il se vante. Le professeur Iruka est son tuteur mais aussi son professeur à l'Académie des ninjas.
L'histoire commence où le maître Hokage est alerté par deux ninjas que Naruto fait encore des siennes. Il barbouille de peinture les portraits des maîtres hokages. C'est alors qu'il se fait réprimander par le professeur Iruka et pour cause : Demain a lieu l'examen qui lui permettra de devenir ninja et auxquel il a déjà échoué par deux fois. Le soir même Iruka l'invite à manger des nouilles(qu'il adore)et c'est là que Naruto expose son rêve :
Devenir Hokage et surpasser tous les autres pour que les autres reconnaissent sa valeur.
Le lendemain, lors de l'examen Naruto tombe sur le sort qu'il aime le moins: Le dédoublement ! Où il échoue bien évidemment. Désespéré de ne jamais recevoir son diplôme, le professeur Mizuki lui donne un tuyau. Le soir, il va voler un rouleau chez le Hokage. Or c'est un rouleau avec des techniques interdites mais Naruto ne le sais pas... Mizuki l'a trompé et s'est servi de lui.
L'alerte donnée, Iruka retrouve Naruto mais ils sont très vite attaqués par Mizuki qui révèlent à Naruto que le démon renard est enfermé en lui. Complètement déboussolé, Naruto comprend maintenant pourquoi tout le monde l'évite.
Au moment où Mizuki s'apprête à le tuer, Iruka s'interpose et subi l'attaque pour lui. C'est alors qu'il lui avoue qu'il est désolé et qu'il ne s'est pas assez occupé de lui, mais Naruto s'enfuit avec le rouleau.
Les 2 adultes le poursuive mais se retrouvent à nouveau face à face et au moment où Mizuki s'apprête à tuer Iruka, Naruto frappe Mizuki qui le menace mais Naruto se défend et le met hors d'état de nuire avec la technique"MULTI-CLONAGE" qu'il a apprit dans le rouleau. Une fois mis hors course, Iruka lui donne son diplôme.
Le lendemain, il fait la connaissance de Konoha-Maru, le petit fils du Hokage. Celui ci veut devenir hokage pour qu'on le reconnaisse tel qu'il est mais le professeur spécial de Konoha-Maru arrive et Naruto le met hors course avec "La technique du Harem" (Très drôle à voir xD). C'est alors que Konoha-Maru lui dit qu'il ne veut plus de lui comme maître et qu'il sont désormais rivaux. C'est là que Naruto dit à Konoha-Maru que lui rentre à l'école des ninjas mais lui dit de s'entraîner et qu'un jour ils s'affronteront pour le titre de Hokage.
Le lendemain, les dîplômés sont répartis par équipes de trois et auront un Sensei. Naruto est réparti avec Sakura Haruno (voir biographie) et Sasuke Uchiwa (voir biographie) et leur maître est Kakashi Hatake (voir biographie).
L' histoire de notre héros commence...